So súťažou sa v osemfinále rozlúčili dva kluby so Slovákmi, dánsky šampión FC Kodaň so stredopoliarom Jánom Gregušom nestačil na Ajax Amsterdam, resp. Borussia Mönchengladbach (László Bénes) vypadol v nemeckom derby so Schalke 04 Gelsenkirchen. A Ajax sa v boji o semifinále stretne práve s klubom z Gelsenkirchenu.

V osudí figurovali dva belgické tímy, okrem Anderlechtu aj K.R.C Genk, ktorý dostal jediného zástupcu španielskej La Ligy Celtu Vigo. Poslednú štvrťfinálovú dvojicu utvorili Olympique Lyon a Besiktas Istanbul. Žreb bol otvorený, neboli nasadené tímy a neplatili žiadne obmedzenia, resp. sa mohli stretnúť aj dva tímy z rovnakej krajiny.

Prvé zápasy štvrťfinále sa budú hrať vo štvrtok 13. apríla, odvetu sú potom na programe o týždeň 20. apríla. Žreb semifinále sa uskutoční v piatok 21. apríla opäť v Nyone (1. zápasy 4. mája, odvety 11. mája-pozn.). Finále sa odohrá v stredu 24. mája o 20.45 SELČ v Štokholme.

Žreb štvrťfinále Európskej ligy UEFA 2016/2017:
Anderlecht Brusel - Manchester United
Celta Vigo - K.R.C. Genk
Ajax Amsterdam - Schalke 04 Gelsenkirchen
Olympique Lyon - Besiktas Istanbul