Hayatou je zároveň viceprezidentom Medzinárodnej futbalovej federácie (FIFA). Tá čelí obrovskej korupčnej kauze, reakciou čoho bola aj abdikácia jej novozvoleného prezidenta Seppa Blattera. Hayatou podľa členky katarského štábu Phaedry Almajidovej spoločne s ďalšími africkými členmi VV FIFA vzal úplatok vo výške 1,5 milióna dolárov za to, aby v hlasovaní o MS 2022 podporili Katar.

„Nikdy v živote som túto ženu nevidel,” bránil sa Hayatou v rozhovore pre Jeune Afrique. „Tvrdí, že som sa stretol s členmi katarskej kandidatúry v hoteli v Angole. Kedy? Kde? Je to číry nezmysel. Požiadali sme ju, aby predložila dôkazy o svojich tvrdeniach, doteraz sa tak nestalo,” dodal kamerunský funkcionár.